Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms