Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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