Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms