Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMB3Q13751 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMB3Q13751 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMB3Q13751 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMB3Q13751 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMB3Q13751 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMB3Q13751 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMB3Q13751 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMB3Q13751 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms