Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
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