Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRQ13535 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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