Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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