Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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