Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM28Q13263 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM28Q13263 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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