Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K1Q13233 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MAP3K1Q13233 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms