Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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