Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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