Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDZK1IP1Q13113 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms