Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms