Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
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