Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF1Q10570 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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