Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
IFFO1Q0D2I5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms