Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms