Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNDQ07001 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms