Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms