Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME1Q06323 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME1Q06323 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms