Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms