Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ERCC6Q03468 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ERCC6Q03468 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ERCC6Q03468 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ERCC6Q03468 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ERCC6Q03468 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ERCC6Q03468 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ERCC6Q03468 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ERCC6Q03468 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ERCC6Q03468 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ERCC6Q03468 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms