Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms