Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms