Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSG6Q00889 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms