Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP2C1P98194 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms