Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD1P98174 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD1P98174 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGD1P98174 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGD1P98174 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGD1P98174 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD1P98174 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD1P98174 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms