Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P62684 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms