Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARSP54136 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARSP54136 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARSP54136 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARSP54136 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARSP54136 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARSP54136 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARSP54136 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARSP54136 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARSP54136 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RARSP54136 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RARSP54136 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARSP54136 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARSP54136 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARSP54136 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARSP54136 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms