Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP98P52948 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP98P52948 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP98P52948 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP98P52948 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP98P52948 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP98P52948 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP98P52948 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP98P52948 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP98P52948 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP98P52948 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP98P52948 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP98P52948 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP98P52948 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP98P52948 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms