Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDGFP51858 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDGFP51858 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDGFP51858 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDGFP51858 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDGFP51858 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDGFP51858 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDGFP51858 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HDGFP51858 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDGFP51858 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDGFP51858 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDGFP51858 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDGFP51858 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDGFP51858 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDGFP51858 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDGFP51858 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDGFP51858 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDGFP51858 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDGFP51858 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HDGFP51858 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDGFP51858 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDGFP51858 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDGFP51858 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms