Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCR4P51679 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCR4P51679 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCR4P51679 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCR4P51679 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCR4P51679 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCR4P51679 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCR4P51679 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCR4P51679 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCR4P51679 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCR4P51679 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms