Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAMP50895 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAMP50895 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAMP50895 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAMP50895 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAMP50895 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAMP50895 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAMP50895 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAMP50895 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAMP50895 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAMP50895 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAMP50895 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAMP50895 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCAMP50895 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms