Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms