Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRXP46100 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRXP46100 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATRXP46100 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATRXP46100 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATRXP46100 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATRXP46100 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATRXP46100 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRXP46100 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRXP46100 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRXP46100 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms