Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGER2P43116 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGER2P43116 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER2P43116 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms