Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP8P40818 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP8P40818 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP8P40818 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms