Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms