Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPC1P35052 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPC1P35052 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
GPC1P35052 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPC1P35052 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms