Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms