Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMO2P25791 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMO2P25791 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMO2P25791 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMO2P25791 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO2P25791 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO2P25791 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO2P25791 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO2P25791 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO2P25791 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms