Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRGP23470 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
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