Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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