Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms