Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms