Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRG2P13727 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRG2P13727 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRG2P13727 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms