Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms