Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms