Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2F1P10589 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms